MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia enterocolitica subsp. palearctica Y11 plasmid pYV03

Total Repeats: 1484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017565	AT	3	6	87	92	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017565	T	6	6	92	97	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017565	GTT	2	6	112	117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017565	CTT	2	6	155	160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017565	CTTTT	2	10	169	178	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017565	TAAA	2	8	186	193	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017565	GCCC	2	8	235	242	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_017565	CAC	2	6	293	298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017565	TTA	2	6	321	326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017565	ACA	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017565	TCA	2	6	337	342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017565	CA	3	6	367	372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017565	GCC	2	6	405	410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017565	TAG	2	6	620	625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017565	GGA	2	6	640	645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017565	AACCGG	2	12	670	681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017565	AAT	2	6	1082	1087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017565	CTG	2	6	1156	1161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017565	GAGCA	2	10	1163	1172	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017565	CCA	2	6	1198	1203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017565	TGT	2	6	1276	1281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017565	AGA	2	6	1312	1317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017565	T	8	8	1390	1397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017565	AT	3	6	1419	1424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017565	AAT	2	6	1586	1591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386307332
26	NC_017565	ATG	2	6	1598	1603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386307332
27	NC_017565	GCT	2	6	1623	1628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386307332
28	NC_017565	ATA	2	6	1729	1734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386307332
29	NC_017565	CCT	2	6	1740	1745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386307332
30	NC_017565	ATC	2	6	1772	1777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386307332
31	NC_017565	CTTT	2	8	1830	1837	0 %	75 %	0 %	25 %	386307332
32	NC_017565	TGG	2	6	1897	1902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386307332
33	NC_017565	ACC	2	6	1952	1957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386307332
34	NC_017565	ATA	2	6	1965	1970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386307332
35	NC_017565	TTTA	2	8	2021	2028	25 %	75 %	0 %	0 %	386307332
36	NC_017565	TAA	2	6	2138	2143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386307332
37	NC_017565	AAT	2	6	2150	2155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386307332
38	NC_017565	TCA	2	6	2199	2204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386307332
39	NC_017565	TAA	2	6	2283	2288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386307333
40	NC_017565	ATTT	2	8	2340	2347	25 %	75 %	0 %	0 %	386307333
41	NC_017565	AAT	2	6	2382	2387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386307333
42	NC_017565	TAA	2	6	2567	2572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386307333
43	NC_017565	TAA	2	6	2654	2659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386307333
44	NC_017565	AC	3	6	2680	2685	50 %	0 %	0 %	50 %	386307333
45	NC_017565	AAT	2	6	2697	2702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386307333
46	NC_017565	ATT	2	6	2751	2756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386307333
47	NC_017565	TCT	2	6	2896	2901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386307333
48	NC_017565	GT	3	6	2904	2909	0 %	50 %	50 %	0 %	386307333
49	NC_017565	GAT	2	6	2919	2924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386307333
50	NC_017565	TGT	2	6	2966	2971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386307333
51	NC_017565	GGGT	2	8	2981	2988	0 %	25 %	75 %	0 %	386307333
52	NC_017565	GTT	2	6	2996	3001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386307333
53	NC_017565	TAA	2	6	3077	3082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386307333
54	NC_017565	TCA	2	6	3089	3094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386307333
55	NC_017565	ACC	2	6	3189	3194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386307333
56	NC_017565	A	6	6	3264	3269	100 %	0 %	0 %	0 %	386307333
57	NC_017565	CTG	2	6	3274	3279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386307333
58	NC_017565	CTG	2	6	3368	3373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386307333
59	NC_017565	AAC	2	6	3396	3401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386307333
60	NC_017565	TAA	2	6	3437	3442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386307333
61	NC_017565	GTT	2	6	3518	3523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386307333
62	NC_017565	TCA	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386307333
63	NC_017565	GTT	2	6	3554	3559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386307333
64	NC_017565	GCGG	2	8	3616	3623	0 %	0 %	75 %	25 %	386307333
65	NC_017565	CT	3	6	3692	3697	0 %	50 %	0 %	50 %	386307333
66	NC_017565	GA	3	6	3698	3703	50 %	0 %	50 %	0 %	386307333
67	NC_017565	AAT	2	6	3793	3798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017565	GTG	2	6	3803	3808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017565	AT	3	6	3926	3931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017565	GATA	2	8	3953	3960	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017565	TG	3	6	3988	3993	0 %	50 %	50 %	0 %	386307334
72	NC_017565	ACC	2	6	4000	4005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386307334
73	NC_017565	A	6	6	4022	4027	100 %	0 %	0 %	0 %	386307334
74	NC_017565	TG	3	6	4076	4081	0 %	50 %	50 %	0 %	386307334
75	NC_017565	TTA	2	6	4106	4111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386307334
76	NC_017565	TGA	2	6	4122	4127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386307334
77	NC_017565	GC	3	6	4183	4188	0 %	0 %	50 %	50 %	386307334
78	NC_017565	T	7	7	4205	4211	0 %	100 %	0 %	0 %	386307334
79	NC_017565	GAA	2	6	4264	4269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386307334
80	NC_017565	TC	3	6	4297	4302	0 %	50 %	0 %	50 %	386307334
81	NC_017565	CAG	2	6	4376	4381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386307334
82	NC_017565	CAG	2	6	4387	4392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386307334
83	NC_017565	GGA	2	6	4565	4570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386307335
84	NC_017565	TGC	2	6	4599	4604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386307335
85	NC_017565	TC	3	6	4628	4633	0 %	50 %	0 %	50 %	386307335
86	NC_017565	AGCCA	2	10	4783	4792	40 %	0 %	20 %	40 %	386307335
87	NC_017565	TGG	2	6	4935	4940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386307335
88	NC_017565	CATGG	2	10	5045	5054	20 %	20 %	40 %	20 %	386307335
89	NC_017565	AGG	2	6	5079	5084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386307335
90	NC_017565	GATG	2	8	5095	5102	25 %	25 %	50 %	0 %	386307335
91	NC_017565	GTT	2	6	5118	5123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386307335
92	NC_017565	AC	3	6	5127	5132	50 %	0 %	0 %	50 %	386307335
93	NC_017565	AAG	2	6	5134	5139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386307335
94	NC_017565	AAC	2	6	5349	5354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386307335
95	NC_017565	TCA	2	6	5607	5612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386307335
96	NC_017565	GAG	2	6	5699	5704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386307335
97	NC_017565	AAG	2	6	5783	5788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386307335
98	NC_017565	CT	3	6	5798	5803	0 %	50 %	0 %	50 %	386307335
99	NC_017565	AGT	2	6	5825	5830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386307335
100	NC_017565	GCA	2	6	5831	5836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386307335
101	NC_017565	GGT	2	6	5857	5862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386307335
102	NC_017565	G	6	6	5914	5919	0 %	0 %	100 %	0 %	386307335
103	NC_017565	ATC	2	6	6042	6047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386307335
104	NC_017565	ATCG	2	8	6064	6071	25 %	25 %	25 %	25 %	386307335
105	NC_017565	AC	3	6	6113	6118	50 %	0 %	0 %	50 %	386307335
106	NC_017565	GC	3	6	6145	6150	0 %	0 %	50 %	50 %	386307335
107	NC_017565	GCA	2	6	6271	6276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386307335
108	NC_017565	CAG	4	12	6290	6301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386307335
109	NC_017565	CTAT	2	8	6320	6327	25 %	50 %	0 %	25 %	386307335
110	NC_017565	GAT	2	6	6445	6450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386307335
111	NC_017565	GGC	2	6	6451	6456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386307335
112	NC_017565	AGG	2	6	6477	6482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386307335
113	NC_017565	TGA	2	6	6496	6501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386307335
114	NC_017565	ACT	2	6	6532	6537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386307335
115	NC_017565	AG	4	8	6585	6592	50 %	0 %	50 %	0 %	386307335
116	NC_017565	GAC	2	6	6607	6612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386307335
117	NC_017565	AT	3	6	6685	6690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017565	AAT	2	6	6725	6730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017565	TTA	2	6	6737	6742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017565	A	6	6	6757	6762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017565	TA	4	8	6768	6775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017565	CAA	2	6	6802	6807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017565	TAT	2	6	6856	6861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017565	T	6	6	6951	6956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017565	ACT	2	6	7066	7071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017565	TCG	2	6	7102	7107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017565	TAA	3	9	7116	7124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017565	AGAA	2	8	7137	7144	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017565	AATA	2	8	7229	7236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017565	AAT	2	6	7256	7261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017565	TGC	2	6	7285	7290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386307336
132	NC_017565	CTGT	2	8	7291	7298	0 %	50 %	25 %	25 %	386307336
133	NC_017565	ATAA	2	8	7393	7400	75 %	25 %	0 %	0 %	386307336
134	NC_017565	ATA	2	6	7494	7499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386307337
135	NC_017565	GGAT	2	8	7520	7527	25 %	25 %	50 %	0 %	386307337
136	NC_017565	ATT	2	6	7543	7548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386307337
137	NC_017565	AATA	2	8	7596	7603	75 %	25 %	0 %	0 %	386307337
138	NC_017565	A	6	6	7658	7663	100 %	0 %	0 %	0 %	386307337
139	NC_017565	ATT	2	6	7775	7780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386307337
140	NC_017565	TGG	2	6	7879	7884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386307337
141	NC_017565	A	7	7	7940	7946	100 %	0 %	0 %	0 %	386307337
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411	NC_017565	CTG	2	6	20217	20222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386307356
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